Фамилия Шиборкин — редкий случай, когда фамилия на -ин образована не от имени, а от прозвища, связанного с ремеслом или инструментом. В её основе лежит слово «шибер» — так в русских говорах называли задвижку, заслонку, вьюшку в печи, а также металлический затвор в механизмах. Суффикс -к- в основе («Шиберк-а») указывает на то, что исходное прозвище звучало как Шиберок или Шиберка — человек, который делал шиберы, торговал ими или носил характерную деталь в одежде.

Модель образования проста: прозвище Шиберка → фамилия Шиборкин. Переход «е» в «о» («Шиберка» → «Шиборкин») — типичное для русской фонетики явление, когда безударный гласный после твёрдого согласного округляется, особенно в диалектной речи. Окончание -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Шиберки», что характерно для фамилий северных и центральных губерний России.

В словарях фамилия не фиксируется у известных дворянских родов, что говорит о крестьянском или ремесленном происхождении. Шибер — слово из обихода печников, кузнецов, мастеровых, работавших с металлом и глиной. Предок Шиборкиных мог быть печником, слесарем или извозчиком, перевозившим печные заслонки. В современных базах фамилия встречается редко, в основном в Поволжье и на Урале — регионах, где печное дело было развито особенно широко.

Любопытная деталь: в отличие от фамилий на -ов, которые часто образовывались от названий профессий с суффиксом -ник (например, Печников), Шиборкин сохранил уменьшительную форму прозвища. Это значит, что прозвище было не официальным, а бытовым, домашним — так могли назвать в деревне человека с характерной приметой, а не по должности. Вторая версия, менее вероятная, связывает основу с диалектным «шибать» (кидать, бить) — тогда Шиберка мог быть драчуном или бойким человеком, но фонетика «шибер» в значении «задвижка» надёжнее подкреплена словарями русских говоров.