Фамилия Шиборин — яркий пример того, как редкий корень может поставить в тупик даже опытного ономатолога. На первый взгляд, перед нами классическая модель отчества с суффиксом -ин, который в русском языке присоединяется к основам на -а/-я: чей? — Шиборин, то есть сын Шиборы. Но вот само прозвище Шибора — большая загадка.

Скорее всего, в основе лежит некалендарное имя или прозвище, связанное с диалектным глаголом «шиборить» или «шибать». В говорах северных и центральных областей России «шиборить» могло означать «шарить, рыться, копаться», а также «говорить невнятно, бормотать». Отсюда и прозвище Шибора — человек, который суетится, копается в мелочах, или же неразборчивый говорун. Менее вероятна, но возможна связь с «шибать» — бить, ударять, однако в этом случае прозвище звучало бы как Шибало или Шибак.

Словообразовательная модель с суффиксом -ин указывает на то, что фамилия закрепилась в среде, где имя или прозвище отца оканчивалось на согласный или -а. Она характерна для центральной и северной России, но в данном случае ареал бытования узок: Шиборины встречаются в основном в Пермском крае и Кировской области. Это наводит на мысль, что фамилия возникла не от общерусского слова, а от местного, возможно, коми-пермяцкого или удмуртского корня. В финно-угорских языках есть похожие звуковые комплексы, означающие, например, «щепка», «осколок» (ср. коми «шиб» — щепка), но это лишь гипотеза.

Версия о происхождении от тюркского имени Шибир (встречается у башкир и татар) маловероятна: фамилия не имеет характерного тюркского суффикса, а русский -ин здесь присоединён к основе, которая в тюркском языке обычно не склоняется по такому типу. Таким образом, Шиборин — это фамилия-загадка, в которой за простым суффиксом скрывается либо редкое диалектное прозвище, либо заимствование из местного языка, адаптированное русской моделью. Носители фамилии — потомки людей, живших на северо-востоке европейской части России, чьё прозвище со временем стёрлось из языка, оставив лишь отпечаток в фамилии.