Фамилия Шикеев — редкий образец, в котором основа и суффикс вступают в неожиданное сочетание. На первый взгляд, она кажется типичной «русской» фамилией с суффиксом -ев, который обычно присоединяют к основам на мягкий согласный или на -й. Но здесь мы видим корень, который явно не славянский, а тюркский. Суффикс -ев в данном случае — поздний паспортный русификатор, адаптировавший нерусское имя под русскую фамильную модель. Если бы фамилия осталась в тюркской среде, она, вероятно, звучала бы как Шикеев без изменений или с другим аффиксом — например, Шикеев-оглы.

Основа фамилии — личное имя или прозвище Шикей. В тюркских языках (татарском, башкирском, чувашском) слово «шик» означает «сомнение», «подозрение», а также «изящество», «щегольство» (от персидского «шик» — «изящный»). Имя Шикей могло быть дано либо человеку, который всегда во всём сомневался (ироничное прозвище), либо, наоборот, щёголю и моднику. Вторая версия более правдоподобна: в тюркской антропонимии прозвища, связанные с внешним видом и манерой одеваться, встречаются часто. Например, татарское имя Шикай или Шикей фиксируется в документах Казанской губернии XIX века.

Есть и другой, более прозаичный вариант: Шикей — это фонетическая адаптация арабского имени Шакир («благодарный») или Шакирджан. В некоторых диалектах, особенно в мишарском говоре татар, звук «а» переходил в «и», а конечный «р» мог отпадать. Так Шакир превращался в Шикей. Тогда фамилия Шикеев означает «потомок Шикея», то есть потомок человека, носившего имя Шакир в местном произношении. Подтверждение этой версии можно найти в ономастических работах Габора Балинта, изучавшего поволжско-татарские имена.

Географически фамилия Шикеев встречается в Поволжье и Приуралье — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это зона расселения казанских татар и башкир, где фамилии на -ев (вместо тюркского -ов) — обычное явление, результат долгого соседства с русским языком. Социально предки современных Шикеевых, скорее всего, были крестьянами или мещанами, принявшими фамилию при переписях XIX века. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» и других родословных сборниках не значится.

Интересная деталь: в русском языке фамилия Шикеев омонимична фамилии, образованной от прозвища Шикай, которое в некоторых северных говорах означало «заика» или «шепелявый». Однако для носителей фамилии из Поволжья эта версия — ложный след. Тюркское происхождение подтверждается и тем, что в метрических книгах XIX века фамилия часто записывалась с «и» в первом слоге, а не с «ы» (Шыкеев), что характерно для передачи татарского «и» на русский лад.