Фамилия Шихерина — женская форма, мужской вариант — Шихерин. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Шихеря. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: Шихерин — «сын Шихери» или «человек из дома Шихери».

Корень «ших-» многозначен. Самая прямая версия — связь с тюркскими языками, где «ших» (şeyh) означает «шейх», «старейшина», «наставник». В русских говорах Поволжья и Приуралья это слово закрепилось как прозвище для уважаемого, мудрого или властного человека. Менее вероятно, но возможно, происхождение от глагола «шихать» — в некоторых диалектах это «толкать», «пихать», «бить». Тогда Шихеря — прозвище драчуна или беспокойного человека. Третья версия, более редкая: от слова «шиха» — так в архангельских и сибирских говорах называли торос, ледяную глыбу или острый бугор. В таком случае прозвище могло достаться человеку с угловатой фигурой или резким характером.

Сам прозвищный суффикс -еря (-ер- + -я) характерен для северо-западных и центральных русских говоров. Он образует экспрессивные, часто пренебрежительные или уменьшительные формы имён и прозвищ: Гуля — Гулера, Косой — Косеря. Шихеря — это не просто Ших, а именно «Ших, да ещё и такой-сякой». Такая модель говорит о том, что фамилия бытовала в среде, где ценилась образная, живая речь.

Географически фамилия Шихерин встречается в основном в центральных регионах России и в Поволжье. В дореволюционных переписях её носители — чаще крестьяне и мещане, реже — купцы. Сословного барьера фамилия не имела: прозвище могло закрепиться за любым, кто выделялся характером или внешностью.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шихов, Шихин, Шиханов) показывает, что Шихерин — более редкая форма. У неё нет «княжеского» звучания, зато есть отчётливый отпечаток народной речи: уменьшительно-пренебрежительный суффикс указывает на то, что прозвище давали в быту, а не в официальной среде. Предок Шихериных, скорее всего, был человеком заметным — либо уважаемым старейшиной (если верна тюркская версия), либо тем ещё «шихателем», задирой, которого запомнили по делам.