Фамилия Шихранкина — женская форма фамилии Шихранкин. Её основа — прозвище или некалендарное имя Шихранка, а оно, в свою очередь, восходит к тюркскому корню. В ономастике такая модель обычна: суффикс -к(а) в русских фамилиях нередко образует уменьшительную или пренебрежительную форму от имени, прозвища или даже названия ремесла. Здесь же, скорее всего, перед нами адаптация тюркского слова.

Корень «шихран» можно связать с арабским «шейх» (старейшина, почтенный человек) через тюркское посредничество. В языках Поволжья и Средней Азии «ших» или «шах» нередко входило в состав имён и прозвищ. Вторая часть — «ран» — могла быть тюркским суффиксом принадлежности или диалектным окончанием. Есть и другая версия: «Шихран» — это искажённое «шахиран», то есть «принадлежащий шаху» или «царский». Правдоподобнее первая гипотеза, так как фамилия бытует в регионах с татарским и башкирским населением — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской области.

Фамилия редкая, и её написание с буквой «и» после «ш» характерно для русской передачи тюркских звуков: в оригинале могло быть «Шихран» или «Шыгран». Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Шихранкин, то есть сын или потомок Шихранки. Это типичная русская модель, наложенная на иноязычную основу.

Сословно носители фамилии, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами, реже — служилыми татарами. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии встречаются среди тептярей и башкир, принявших православие или сохранивших мусульманские имена, но записанных по-русски. Полной ясности с этимологией нет из-за малочисленности фамилии, но тюркское происхождение основы — самый надёжный вариант.