Фамилия Шимошенко — характерный пример украинской модели образования фамилий на -енко. Суффикс -енко, по распространённому мнению ономастов, изначально имел значение «маленький» или «сын», то есть Шимошенко — это буквально «сын Шимоша» или «маленький Шимош». В украинской антропонимии этот суффикс стал одним из самых массовых с XVII века, особенно на Левобережье и Слобожанщине, и фамилии на -енко редко указывали на социальный статус — их носили и крестьяне, и казаки, и мещане.

Основа фамилии — Шимош, вероятнее всего, производная форма от имени Симон (в просторечии Шимон). В украинских говорах имя Симон нередко переделывали в Шимон, а уже от него образовывали уменьшительные варианты: Шимош, Шимець, Шимко. Подобные трансформации типичны для народной речи, где иноязычные звуки заменялись на привычные: мягкое «с» переходило в «ш», а окончание усекалось. Встречается и версия о возможной связи с диалектным глаголом «шимошити» — в некоторых западноукраинских говорах это означало «суетиться, делать что-то торопливо», но она менее убедительна: прозвищные фамилии на -енко от глаголов редки, а Шимошенко явно вписывается в патронимический ряд.

Географически фамилия Шимошенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Черкасской, Полтавской, Киевской. В России она встречается гораздо реже, обычно в южных регионах, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. В дореволюционных переписях носители фамилии записывались преимущественно как крестьяне и казаки, без указания на дворянское происхождение — суффикс -енко в сочетании с простым именным корнем почти не встречается в родословных книгах шляхты.

Примечательно, что фамилия Шимошенко не имеет варианта с окончанием -ов (Шимошенков), который часто появлялся при адаптации украинских фамилий в русской среде. Это говорит о том, что основная масса носителей оставалась в украинском культурном ареале или переселялась компактными группами, не смешиваясь с великорусским населением. Если ваши предки носили эту фамилию, с высокой вероятностью они происходят из семьи, где имя Симон (Шимон) передавалось через поколение, а фамилия закрепилась как родовое прозвание где-то в середине XVII — начале XVIII века.