Фамилия Шипотило — редкий пример украинской фамилии с прозрачной, но неочевидной внутренней формой. В основе лежит глагол «шипотати» или существительное «шипіт» — в украинских говорах это не только шипение, но и тихий, прерывистый звук, шёпот, шелест. Человек по прозвищу Шипотило мог получить его за манеру говорить тихо, шипеть или издавать характерные звуки — например, при работе с деревом или металлом.

Суффикс -ило в украинских фамилиях выполняет роль активного деятеля, как в словах «косило» (тот, кто косит) или «молотило» (то, чем молотят). Шипотило — буквально «тот, кто шипотит», то есть издаёт шипение. Такая словообразовательная модель типична для восточнославянских прозвищ, особенно на Правобережной Украине. Фамилия могла закрепиться за человеком в XVI–XVII веках, когда украинские казацкие и крестьянские прозвища активно переходили в наследственные фамилии.

Географически Шипотило встречается почти исключительно на западе Украины — в Тернопольской, Хмельницкой, Ровненской областях. Единичные носители есть в Беларуси и Польше, но это следы миграций конца XIX — начала XX века. В современной России фамилия практически не фиксируется, что подтверждает её узкорегиональный характер.

Спорных версий происхождения немного. Можно предположить связь с «шип» — колючка, шиповник, но тогда ожидалась бы форма Шипотенко или Шипотько. Суффикс -ило указывает именно на действие, а не на предмет. Поэтому версия с «шипением» или «шёпотом» выглядит убедительнее — она объясняет и суффикс, и редкую огласовку корня.

В дореволюционных метрических книгах фамилия записывалась как Шипотило, без вариантов. Изменений ударения не зафиксировано — оно падает на второй слог: Шипо́тило. Это ставит фамилию в один ряд с такими же украинскими прозвищами-деятелями, как Крутило, Мочило, Возило — все они образованы от глаголов и описывают характерное действие.