Фамилия Шиптя — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корни, нужно в первую очередь посмотреть на суффикс. Окончание -я в русских фамилиях встречается нечасто, и оно почти всегда указывает на украинское или белорусское происхождение. В этих языках суффикс -я мог оформлять прозвища или названия профессий, превращая их в фамилии без дополнительных патронимических суффиксов (как -ов или -ин). Таким образом, Шиптя — это, скорее всего, украинская или южнорусская фамилия, образованная от прозвища Шиптя.

Само прозвище, вероятнее всего, связано со словом «шип». В прямом смысле так могли назвать колючего, неуживчивого человека — того, кто «колется» в общении, как репей. В переносном смысле «шипом» на юге России и в Украине могли называть и острую на язык, язвительную личность. Менее вероятная, но возможная версия — связь с глаголом «шипеть». В таком случае прозвище Шиптя мог получить человек с шипящим, невнятным голосом или, опять же, сварливый, «шипящий» в разговоре.

С точки зрения географии, фамилия Шиптя должна быть локализована в регионах, где исторически сильна украинская топонимика и фамильная модель на -я. Это Черниговская, Полтавская, Харьковская области Украины, а также прилегающие области России — Курская, Белгородская, Воронежская. Встретить её в центральной или северной России маловероятно.

В словарях украинских фамилий (например, в работах Ю. К. Редько) фамилии с основой «Шип-» и суффиксом -я фиксируются как прозвищные, образованные от характеристики внешности или поведения. Сравните с фамилиями Шип, Шипенко, Шипченко — все они из одного гнезда, но Шиптя стоит особняком из-за редкого окончания. Это не патроним (не «сын Шипа»), а прямое прозвище, закрепившееся за родоначальником.

Таким образом, предок носителя фамилии Шиптя был, скорее всего, человеком с острым языком или колючим характером, жившим в украинской или южнорусской среде. Фамилия не получила широкого распространения и осталась редкой, что типично для прозвищ, которые не перешли в массовые модели фамилий на -ов.