Фамилия Шипуш — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Сразу бросается в глаза, что она не укладывается в привычные модели русских фамилий: нет суффиксов -ов/-ев, -ин, -ский. Это наводит на мысль, что перед нами либо позднее образование (возможно, из польской или украинской традиции, где фамилии без суффикса встречаются чаще), либо вариант, записанный на слух в переписи.

Самая прямая версия — от прозвища Шипуш. В русских говорах «шипуш» могло означать того, кто шипит, ворчит, или же человека с хриплым, сиплым голосом (сравните с «шипеть»). В этом случае фамилия — характеристика поведения или говорения. Менее очевидный, но возможный вариант — связь с диалектным словом «шип» (колючка, шиповник), и тогда Шипуш — это «колючий», неуживчивый человек. Третья версия, более экзотичная, — происхождение от тюркского имени или прозвища, где корень «шип» мог означать что-то острое или быстрое, но для этого нужны дополнительные данные.

Географически фамилия Шипуш встречается крайне редко. Если отталкиваться от современных баз данных, носители фиксируются в основном в западных регионах России и на Украине. Это косвенно подтверждает версию о польском или малороссийском влиянии: там фамилии вроде Шипуш, Шипула, Шипун не редкость. В центральной России такую фамилию скорее переделали бы в Шипушин или Шипунов.

С точки зрения словообразования, суффикс -уш характерен для уменьшительных или прозвищных форм в украинском и белорусском языках (сравните: дідусь, бабуся). То есть Шипуш могло быть ласкательным или пренебрежительным прозвищем от того же «шип»: «маленький колючка» или «ворчун». В таком случае фамилия — прямое, без изменений, закрепление этого прозвища за потомками.

Сословная принадлежность предков неясна: фамилия не даёт подсказок. Ни дворянских родов Шипуш, ни крестьянских династий в открытых источниках не описано. Скорее всего, это фамилия одного из непривилегированных сословий, возникшая не раньше XVIII века, когда прозвища начали массово фиксироваться как наследственные.