Фамилия Шишмарина — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Шишмарин. Это типичная «патронимическая» фамилия, образованная с помощью суффикса -ин, который в русской традиции указывал на принадлежность: «чей сын?» — Шишмарин, то есть сын Шишмары. Вся смысловая нагрузка ложится на прозвище или некалендарное имя Шишмара.

Корень здесь — «шиш». В древнерусском языке у этого слова был широкий спектр значений: от «острый предмет», «шишка» (в прямом и переносном смысле — «важное лицо») до «бродяга», «вор» и даже «чёрт». Вторая часть, -мара, — более спорная. Скорее всего, это либо усилительный элемент (как в слове «кутерьма»), либо диалектное «мара» — «призрак», «морок». Таким образом, Шишмара — сложное прозвище, которое могло означать «шишка морока», то есть человек, производящий много шума, суеты, или же «важный призрак» — ироничная характеристика. В любом случае, имя звучало экспрессивно и давалось, вероятно, человеку с заметным, неспокойным характером или внешностью.

В русской ономастике фамилия Шишмарин фиксируется в разных регионах, но наиболее плотно — в Поволжье и центральных областях России. Встречается она и в среде донских казаков. Это указывает на то, что прозвище Шишмара было не единичным, а бытовало в народной среде, и фамилия возникла независимо в нескольких местах. Обратите внимание на суффикс -ин: он характерен для фамилий, образованных от основ на -а, -я, что подтверждает словообразовательную модель «Шишмара → Шишмарин». Это отличает её от фамилий на -ов (Шишков, Шишов), которые пошли от основ на согласный.

В отличие от более распространённых «шишкинских» фамилий, Шишмарина сохранила редкую двухкорневую основу. Она не связана с растением (шишка сосны) напрямую, а уходит в мир древних прозвищ, где смешивались бытовая меткость и народная фантазия.