Фамилия Шистовская — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную версию. Её основа — «шист» — в русском языке не имеет самостоятельного значения, зато в топонимике встречается не раз. Наиболее вероятный источник: название населённого пункта вроде Шистово, Шистов или Шистовка. Такие деревни и хутора существовали в нескольких губерниях — в частности, в бывшей Тверской, Смоленской и Псковской. Фамилию на -ский/-ская обычно получали дворяне по названию своего поместья, а также выходцы из духовенства, которым давали фамилию по селу или погосту, где служил отец.

Модель образования проста: основа Шист- плюс суффикс -ов-/-ев- (притяжательный) и топонимический суффикс -ск-. Получается «относящийся к Шистову» или «родом из Шистова». Если бы фамилия произошла напрямую от прозвища Шист (например, от диалектного «шист» — возможно, искажённое «шест» или «чист»), мы бы скорее увидели вариант Шистов или Шистин. Суффикс -ская ясно указывает на территориальную, а не патронимическую природу.

Версия с прозвищем, впрочем, тоже имеет право на существование, хотя и слабее. В некоторых говорах «шист» могло означать «прут», «хворостина» — отсюда прозвище высокого или худого человека. Тогда Шистовский — это уже «сын Шиста», где суффикс -овск- выполняет роль притяжательного. Но в русской ономастике фамилии на -овский обычно вторичны и восходят к топонимам, а не к личным прозвищам.

Сословная принадлежность носителей фамилии Шистовская в прошлом, скорее всего, была неоднородной. Если корни — в дворянском поместье, то это мелкопоместное дворянство. Если в духовенстве — то фамилия типична для выпускников семинарий, получавших «географическую» фамилию при поступлении. Встречается Шистовская и среди крестьян, переселившихся из деревни Шистово в город и записанных по месту выхода.

В написании фамилии возможна путаница: в дореволюционных документах её могли фиксировать как Шистовская, так и Шистовская (с одним «с»), но нормативным стало двойное «с» — по аналогии с суффиксом -ск-. Родственные фамилии — Шистов, Шистовский, Шистова — встречаются чаще, что подтверждает: именно топоним, а не прозвище, породил этот редкий женский вариант.