Фамилия Шкайдуров — редкий случай, где основа, скорее всего, не русская, а тюркская, а суффикс — типично русский. Разберём её по косточкам.

Корень «шкайдур» (или «шкайдыр») восходит к тюркскому глаголу со значением «отскакивать», «отпрыгивать» или «уворачиваться». В диалектах башкирского и татарского языков слово «шкайдырыу» означает «ударом отбрасывать», «отшибать». Отсюда прозвище Шкайдур — человек, который либо сам резок в движениях, либо, что вероятнее, имел профессию, связанную с отбиванием, отколачиванием чего-то (например, при работе с камнем или в кузнечном деле, где искры и осколки отлетают). Прямых аналогов в славянских языках нет, поэтому версия о тюркском заимствовании — основная.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель русской фамилизации XVI–XIX веков. Когда татарин, башкир или другой нерусский получал фамилию, к его прозвищу (или имени) прибавляли русское окончание принадлежности: «чей? — Шкайдуров». Это не значит, что предок обязательно был мусульманином — фамилию могли дать и крещёному, инородцу, перешедшему в православие.

Географически фамилия привязана к зоне смешения русского и тюркского населения: Поволжье, Урал, Западная Сибирь. Встречается в Оренбургской, Челябинской областях и в Татарстане. В центральных русских губерниях она почти не фиксируется, что подтверждает её региональный характер.

Словообразовательный нюанс: в фамилии нет уменьшительного или пренебрежительного суффикса (вроде -к- или -ишк-), значит, прозвище Шкайдур воспринималось как нейтральное или уважительное — либо по ремеслу, либо по характеру. Это отличает её от фамилий вроде Шкайдуренко (украинский вариант) или Шкайдуркин (с суффиксом -ин, что редко для такой основы).

Если ваш предок носил фамилию Шкайдуров, он с высокой вероятностью был выходцем из среды служилых татар, башкирских казаков или крестьян-старообрядцев, живших в контактной зоне. Точного дворянского родословия по ней нет — фамилия осталась в народной среде.