Фамилия Шкайдерова — женская форма мужской фамилии Шкайдеров, и её происхождение стоит искать не в очевидных славянских корнях, а в прозвище, которое могло прийти из южнорусских или украинских говоров. Основа «шкайдер» с большой вероятностью восходит к диалектному глаголу «шкайдать» — так в некоторых областях говорили о небрежной, размашистой работе или о человеке, который делает что-то кое-как, «швырком». В украинском языке есть слово «шкайдер» — неряха, разгильдяй. Соответственно, прозвище Шкайдер давали нерадивому работнику или тому, кто отличался неаккуратностью в быту. Фамилия образована по типичной русской модели: к основе прозвища добавился суффикс принадлежности -ов, а затем окончание -а для женского рода.

Суффикс -ов в фамилии Шкайдеров указывает на то, что закрепилась она в среде, где преобладал великорусский тип образования фамилий (вопрос «чей?» — сын Шкайдера). Это отодвигает версию о прямом заимствовании из западных языков: хотя на слух фамилия напоминает немецкую фамилию Schneider (портной), звуковое сходство здесь обманчиво. В немецком варианте мы бы ожидали окончания -ер или -ерман, а не -ов. Кроме того, для русских фамилий от немецких корней типична другая морфология (например, Шнейдеров, Шмидтов), и Шкайдеров стоит особняком — скорее всего, это местное, диалектное слово, а не искажённое иноязычное имя.

Географически фамилия редкая и тяготеет к югу России — Ростовской области, Краснодарскому краю, а также к востоку Украины. В дореволюционных переписях она почти не встречается, что говорит о позднем оформлении: прозвище Шкайдер могло закрепиться как фамилия уже в XIX веке среди крестьян или мещан, а не дворян. Сословной окраски у неё нет — это «бытовая» фамилия, образованная от характеристики человека, а не от имени или ремесла.

Если сравнивать с однокоренными, то в русских говорах есть фамилии Шкайда, Шкайдин, Шкайдов — все они происходят от того же корня со значением небрежности. Ударение в фамилии Шкайдерова, скорее всего, падает на второй слог (Шка́йдерова), хотя в устной речи возможны варианты. Для носителя фамилии это ключевая зацепка: предки, вероятно, жили в среде, где ценили аккуратность и труд — и прозвище дали за обратное.