Фамилия Шкренина — женская форма, мужской вариант — Шкренин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Шкреня. Слово «шкреня» в русских говорах фиксируется редко, но имеет прозрачную этимологию: это «шкерёнок» или «шкерёныш» — детёныш животного, чаще всего щенок. В пермских и вятских говорах «шкреня» означало также «малорослый, тщедушный человек» или «непоседа, егоза». Таким образом, фамилия образована по типичной восточнославянской модели: основа на -а + суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Шкренин, то есть сын или потомок Шкрени.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «шкерять» (скрести, чистить, обдирать). В этом случае Шкреня — прозвище человека, занятого чисткой рыбы, кожи или чего-то подобного. Однако «шкерять» и производные обычно дают фамилии типа Шкеря, Шкерёв, а не Шкренин. Поэтому версия с «детёнышем» или «малорослым» надёжнее.

География фамилии узкая. Шкренины встречаются преимущественно на Русском Севере и в Поволжье — в Архангельской, Вологодской, Кировской областях, а также в Пермском крае. Это объясняется сохранением диалектного слова, не ушедшего в общерусский язык. В центральных и южных регионах фамилия редка.

С точки зрения социального происхождения, Шкренины — почти наверняка крестьянская или посадская фамилия. Суффикс -ин типичен для прозвищных фамилий низших сословий, а сама основа — бытовое, не книжное слово. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В северных говорах чаще говорят Шкренина́ (с ударением на последний слог), в среднерусских — Шкре́нина. Это не ошибка, а отражение разной акцентологической нормы в регионах.