Фамилия Шлакайтис звучит для русского уха непривычно, и это главная подсказка: перед нами типично литовская фамилия. Её выдает суффикс -айтис (-aitis), который в литовской ономастике указывает на происхождение от отца или предка. Если говорить просто, Шлакайтис — это «сын Шлакаса» или «потомок Шлакаса». Такая модель образования фамилий (патроним на -aitis) массово закрепилась в Литве в XIX — начале XX века, когда шло оформление фамилий для крестьянского сословия.

Основа фамилии — Шлакас (Šlakas). В литовском языке слово šlakas имеет несколько значений, и все они связаны с бытовой или природной средой. Основное — «капля», «брызга», «крапинка». Прозвище Шлакас могли дать человеку с веснушками или родинками, то есть «крапчатому», «пятнистому». Второе, более редкое значение — «шлак», металлургический отход, но вряд ли оно легло в основу фамилии: для прозвища это слишком отвлеченно и технично. Вероятнее всего, предок носителя фамилии получил прозвище по внешнему признаку.

Географически фамилия Шлакайтис тяготеет к северо-востоку Литвы и приграничным районам Латвии. Встречается она нечасто, оставаясь локальной. В русском языке фамилия сохранила литовское окончание, не обрусев до Шлакайтина или Шлакаева, — это говорит о том, что ее носители, возможно, переселились в другие регионы уже в XX веке, когда процесс адаптации фамилий замедлился.

Сравнение с однокоренными литовскими фамилиями (Шлакаускас, Шлакявичюс) показывает, что все они восходят к одному корню šlak-, но разные суффиксы указывают на разные ветви рода или разные эпохи образования. Шлакайтис — самая «младшая» форма, типичная для крестьянских фамилий, тогда как Шлакаускас могла принадлежать более старым шляхетским родам, хотя это нестрогое правило. В любом случае, фамилия Шлакайтис — это компактный маркер литовского происхождения и сельских корней ее носителя.