Фамилия Шлатгауэр — одна из тех, что сразу выдают немецкое или австро-баварское происхождение. Она составная, типичная для немецкой ономастики: в основе лежат два корня. Первый — «Schlatt» (в диалектах южной Германии и Швейцарии — «тростник», «камыш», а также «болотистая низина, поросшая камышом»). Второй — «Gauer» (от «Gau» — «округ, область»; суффикс -er указывает на жителя или уроженца). Таким образом, Шлатгауэр — это «житель болотистой местности» или «человек из камышового края». Буквально фамилия отвечает на вопрос «откуда родом?» и закрепилась за теми, кто переселился из конкретной местности с таким названием.

Словообразовательная модель — типичная для немецких фамилий-прозвищ по месту жительства. Суффикс -er в немецком языке выполняет ту же роль, что русские суффиксы -ский/-ской или -ин: он превращает топоним в фамилию. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто были отчествами, немецкие фамилии на -er почти всегда указывают на географическое происхождение человека.

Вероятнее всего, фамилия возникла в южнонемецком языковом ареале — в Баварии, Баден-Вюртемберге или в австрийских землях. Там слово «Schlatt» в значении «болото, трясина» активно использовалось в местных говорах. В письменных источниках фамилия могла фиксироваться в вариантах Schlattgauer, Schlattgauerer, а на письме упростилась до современного Шлатгауэр.

Стоит отметить, что фамилия редкая. В России и странах бывшего СССР она встречается в основном у потомков немецких колонистов, переселявшихся в XVIII–XIX веках по приглашению Екатерины II и Александра I. Поволжские немцы, меннониты и колонисты из Причерноморья часто сохраняли такие «говорящие» фамилии, не переводя их на русский лад. Поэтому Шлатгауэр — это не прозвище по профессии или внешности, а четкая географическая метка, которая ведет предков носителя в конкретную болотистую долину на юге Германии.