Фамилия Шляйнин — один из тех случаев, где за привычным русским суффиксом -ин скрывается нерусская основа. Если не вчитываться, можно решить, что перед нами типичная «матронимическая» фамилия вроде Марьин или Катин, образованная от женского имени Шляйна. Но такого имени в русских святцах нет, и корень здесь совсем другой.

Основа фамилии — слово «шляйня». В южнорусских и украинских говорах так называли слюну или слюнявого, неопрятного человека. Слово звукоподражательное, от «шля́пать» или «шлёпать» губами. Прозвище Шляйня могли дать неаккуратному, вечно мокрогубому ребёнку или неряшливому взрослому. Суффикс -ин в русской модели фамилий работает как притяжательный: «чей?» — Шляйнин, то есть сын или потомок Шляйни.

Версия с немецким корнем (от фамилии Шляйн, Schleien) менее вероятна. Немецкие фамилии на -ин в русской среде обычно переделывали в Шляйнов или Шлейнов, а форма на -ин характерна именно для прозвищ. Кроме того, фамилия Шляйнин встречается почти исключительно в русских регионах, где были распространены диалектные «шляйня» и «шляйный» — например, в бывших Курской и Воронежской губерниях.

Редкий суффикс -ин при основе на -я (Шляйня) даёт фамилии, которые ономасты относят к категории «полуотчественных»: они фиксируют прозвище, а не крестильное имя. Такие фамилии часто возникали в среде однодворцев и государственных крестьян юга России, где мирские имена держались дольше, чем в центральных областях. Если ваш предок носил прозвище Шляйня, он, скорее всего, был крестьянином или ремесленником из чернозёмной полосы, и фамилия закрепилась за его потомками в XIX веке при переписях.