Фамилия Шлюдин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от большинства русских фамилий на -ин, образованных от крестильных имён (Иван → Иванов, Ильин), основа здесь тёмная и вызывает споры.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Шлюда. В русских говорах слово «шлюда» или «шлюдка» имело несколько значений, и все они нелестные. В северных и сибирских диалектах так называли неопрятную, неряшливую женщину, а также сплетницу или пустомелю. В этом случае фамилия образована по типичной модели: прозвище матери или жены (по «женской» линии) + суффикс -ин, означающий «чей?» — то есть «сын Шлюды». Подобные «матриархальные» фамилии (Мамин, Тётин, Бабин) на Руси давали, если женщина была главой дома или прозвище закрепилось за родом через неё.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с искажённым вариантом слова «шлюз» или «шлюпка» — тогда предок мог быть работником на воде. Но эта гипотеза слабая: для прозвища по профессии скорее подошла бы форма Шлюзов или Шлюпкин.

Суффикс -ин указывает на то, что фамилия сформировалась в среде простого люда — крестьян или посадских, а не дворянства. Географически фамилия Шлюдин встречается крайне редко, в основном в центральных областях России и на Урале, но нигде не образует заметных гнёзд. Это говорит о том, что родоначальник, вероятно, был одиноким носителем прозвища, которое не получило широкого распространения.

Интересно, что в старых переписных книгах XVII–XVIII веков фамилия не фиксируется, что подтверждает её более позднее происхождение (вероятно, XIX век) или локальный характер. Если искать однокоренные аналоги, то ближе всего фамилия Шлюндин — с тем же корнем, но с другим суффиксом, что лишний раз доказывает диалектную природу прозвища.

Таким образом, Шлюдин — это фамилия-прозвище, скорее всего, данная по женской линии и указывающая на некий бросающийся в глаза недостаток характера или внешности предка.