Фамилия Шлюкин — один из тех случаев, где внешняя простота обманчива. На первый взгляд, очевидная основа «шлюк» и суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Шлюка). Но что такое «шлюк»? Здесь открывается простор для версий, и ни одна из них не лежит на поверхности.

Самое правдоподобное объяснение ведет к диалектному слову «шлюк» — так в некоторых русских говорах (особенно на юге и западе) называли шлык, высокий колпак или головной убор. Шлык носили и мужчины, и замужние крестьянки. Прозвище Шлюк (или Шлык) могли дать человеку, который постоянно носил такой головной убор, шил их или просто имел характерную, «колпаком», форму головы. В этом случае фамилия Шлюкин — типичная «шапочная» фамилия, в одном ряду с Колпаковым, Шапкиным или Картузовым.

Однако есть и другая, более редкая версия. В некоторых западных и псковских говорах «шлюк» означало нечто кривое, изогнутое, а также — хромого человека. Слово родственно глаголу «шлюкать» (ковылять, ходить вразвалку). Если это так, то прозвище Шлюк могло указывать на походку или физическую особенность. Эта версия менее распространена, но лингвистически вполне состоятельна: образование прозвищ от дефектов походки — обычное дело (вспомним фамилии Хромов, Косолапов, Лихой).

Суффикс -ин в фамилии Шлюкин — классический патронимический суффикс, который в центральной и северной Руси часто заменял -ов/-ев. Он указывает, что фамилия образована от прозвища или неканонического имени Шлюк, а не от названия профессии, оканчивающегося на -а. Носители фамилии исторически концентрировались в регионах, где бытовали соответствующие говоры: Псковская, Смоленская, частично Тверская губернии. Встречается фамилия и на Урале, куда переселенцы принесли её с собой.

Стоит отмести популярное, но ложное сближение с голландским словом «sluis» (шлюз) или немецким «Schlucht» (ущелье). Для русской фамилии, особенно с суффиксом -ин, такие заимствования маловероятны и не подтверждаются историей русского прозвищного именования. Шлюкин — фамилия коренная, и её корни — в русской диалектной лексике, а не в гидротехнике или географии.