Фамилия Шморгонер — наглядный пример того, как фамилия может быть не просто прозвищем, а географическим паспортом предка. Её основа — топоним Шморгонь (старое название города Сморгонь в современной Беларуси). В польском и белорусском произношении название города закрепилось в форме «Шморгонь», что и дало фамилию. Суффикс -ер в данном случае — типичный для западных славянских и балтийских языков показатель принадлежности к месту: он указывает на выходца из Шморгони.

В русском контексте фамилия могла быть адаптирована как Шморгонер, хотя её исконная восточнославянская форма — Шморгонский. Разница в суффиксе говорит о том, что предок носителя фамилии, вероятно, принадлежал к польской или еврейской общине местечка Сморгонь. В Речи Посполитой, куда входили эти земли, фамилии на -ер были распространены у горожан, особенно у еврейского населения, которое часто получало фамилии по месту жительства с таким окончанием.

Сам город Сморгонь известен с XVI века, а его название, по одной из версий, происходит от балтийского корня со значением «грязь» или «топь». Другая, более живописная версия связывает его с «морг» — старинной мерой земли. В любом случае, фамилия Шморгонер прямо говорит: «Я из Сморгони». Встречается она преимущественно в западных регионах бывшей Российской империи, а также среди потомков эмигрантов в Израиле и США. Из-за редкости и неочевидной для русского уха основы, её часто путают с немецкими фамилиями, оканчивающимися на -ер, хотя происхождение у неё славяно-балтийское.