Фамилия Шнаратов — редкий случай, когда русская фамилия образована от немецкого корня, но с помощью типично русского суффикса принадлежности -ов. Основа здесь — «шнарат». Скорее всего, это искажённое или адаптированное на русской почве немецкое слово Schnarr, которое в южных диалектах Германии означало «сварливый человек» или «ворчун», а в некоторых областях — «сверчок» (насекомое, издающее трескучий звук). Корень восходит к глаголу schnarren — «трещать», «жужжать» или «говорить резким голосом».

Вероятный путь фамилии в Россию — через приглашённых в XVIII–XIX веках немецких мастеров, ремесленников или колонистов, которых селили в Поволжье, под Петербургом и в Новороссии. В среде немецких поселенцев прозвище Schnarr, Schnarrat (с возможным суффиксом -at как в фамилиях типа Bickert, Eckert) могло закрепиться за человеком с резким голосом или сварливым характером. При переходе в русскую среду фамилия получила окончание -ов, что сделало её формально похожей на русские отчества, но корень остался чужеродным.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с идишским или западнославянским словом, означающим «шнурок» или «верёвка» (ср. немецкое Schnur). В таком случае прозвище могло относиться к торговцу галантереей или портному. Однако фонетика фамилии (звук Ш, ударение на второй слог) больше тяготеет к первому варианту.

Географически фамилия Шнаратов встречается в России крайне редко, её носители живут в основном в центральных областях и в Сибири, что типично для потомков немецких колонистов, которые в XX веке были депортированы или переселились вглубь страны. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была мещанской или крестьянской — среди немецких колонистов было мало дворян. Стоит заметить, что фамилия не имеет отношения к тюркским или кавказским корням, несмотря на характерный звуковой облик: её происхождение — однозначно европейское, немецкое.