Фамилия Шникере — редкий случай, когда исходное слово почти не изменилось, перейдя в фамилию. Корень здесь прозрачен: «шникер» или «шникерь». В русских говорах, особенно юго-западных и украинских, «шникер» — это хитрый, пронырливый человек, ловкач, а иногда и мелкий воришка. Слово имеет явную экспрессивную окраску, и фамилия, скорее всего, родилась как прозвище: так могли назвать изворотливого соседа или расторопного мальчишку.

Обратите внимание на окончание. Фамилия застыла в форме именительного падежа, без типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Это указывает на то, что перед нами не «сын Шникера» (что дало бы Шникеров), а прямое прозвище, которое стало фамилией без переоформления. Такая модель встречается в основном на Украине, в Беларуси и в южных областях России. В польском языке есть слово «snikerz» (ловкач, вор), что подтверждает западнославянский след.

Вероятно, предок носителя фамилии получил это прозвище за свой характер или род занятий. Не обязательно за воровство — скорее за умение выкрутиться из любой ситуации, найти выгоду, договориться. В крестьянской среде такое качество могли и осуждать, и уважать, в зависимости от обстоятельств.

Фамилия Шникере не числится в массовых списках русского дворянства или купечества. Это фамилия простонародная, скорее всего, однодворческая или крестьянская. Встречается она крайне редко, и её носители, вероятно, сосредоточены в одном-двух регионах, где говоры сохранили это слово. В современной России фамилия практически не встречается, что делает её уникальной для генеалогического поиска.