Фамилия Шныкина — женская форма фамилии Шныкин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Шныка. Эта фамилия редкая и относится к так называемым «говорящим» прозвищам, которые в древности давали по особенностям поведения или внешности. Основа «шнык-» в русских говорах имела несколько значений, и ключевое из них — «шнырять, рыскать, соваться повсюду». Шныкой могли назвать непоседливого, юркого человека, который всюду поспевал, или же, наоборот, того, кто вел себя скрытно, «шнырял по углам». В ряде диалектов слово «шнык» также означало «нос» (например, в курских и орловских говорах), так что прозвище могло относиться к человеку с длинным или острым носом. Менее вероятная, но возможная версия — связь с украинским или белорусским «шнити» (резать, кроить), тогда прозвище могло указывать на портного или сапожника.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: Шныкин — сын или потомок Шныки. Такая модель типична для фамилий, возникших из прозвищ или мирских имён в XV–XVII веках. В писцовых книгах и переписях XVI–XVII веков встречаются единичные упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Шныка, но массового распространения фамилия не получила. Географически Шныкины чаще всего фиксируются в центральных и южных регионах России — в Тульской, Орловской, Рязанской губерниях, где диалектное слово «шнык» было в ходу. Встречаются также в Сибири, куда фамилия могла попасть с переселенцами.

Стоит обратить внимание на редкий суффиксальный вариант — Шныкин, который сохраняет древнюю форму без смягчения основы. В отличие от более частых фамилий на -ов, суффикс -ин указывает на основу, оканчивающуюся на -а или -я, что подтверждает прозвищное происхождение. В современной России фамилия Шныкина остаётся малочисленной: по данным открытых телефонных справочников, её носительницы живут в основном в Центральном федеральном округе, реже — на Урале. Никаких сведений о дворянском или купеческом происхождении этой фамилии нет: она однозначно крестьянская или мещанская, что подтверждается отсутствием в родословных книгах.