Фамилия Шнынов — одна из тех, где основа ясна, а вот её исходное значение удивляет. В её основе лежит прозвище Шнын, образованное от глагола «шнырить» или «шнырять», что в старых говорах означало «рыскать, шарить, соваться повсюду, выведывать». Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был непоседой, всюду сующим нос, либо тем, кто занимался поиском — например, разведчиком или сыщиком. В некоторых диалектах «шнын» могло быть ироничным именем для мелкого воришки или попрошайки, который шныряет по базарам.

Модель образования проста и типична для русского севера и центра: прозвище на твёрдый согласный плюс патронимический суффикс -ов. То есть Шнынов буквально значит «сын Шнына». Фамилия не могла возникнуть у духовенства (там были бы формы на -ский) и не похожа на дворянскую — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, закрепившаяся в XVI–XVII веках.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий от глагола «шнырять» (Шнырёв, Шныркин), форма Шнынов встречается реже и тяготеет к северным и вологодским говорам, где корень «шнын» бытовал как самостоятельное слово. В некоторых переписях XVIII века встречается вариант Шнынов — с ударением на первый слог, что тоже указывает на северное происхождение (южане чаще ставили ударение на окончание).

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Шнынов — не искажённая форма какой-то другой фамилии, а самостоятельное образование. Связи с еврейскими или немецкими корнями нет, несмотря на созвучие с идишскими фамилиями на -ов. Это чисто русское прозвище, отражающее не профессию, а характер или поведение предка.