Фамилия Шобина — женская форма, мужской вариант — Шобин. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Шоба. Такие имена-прозвища были распространены в русской деревне до XVIII века, пока Пётр I не ввёл обязательные фамилии для всех сословий. Шобой могли назвать человека за какую-то характерную черту, но точное значение слова сегодня вызывает споры.

Самая правдоподобная версия связывает Шобу с диалектным глаголом «шобить» — в некоторых говорах это означало «делать что-то быстро, проворно», а в других — «шататься, бродить без дела». В первом случае прозвище давали расторопному работнику, во втором — непоседе или праздному человеку. Слово могло звучать и как «шобоня» — так в тверских и псковских говорах называли неуклюжего, неопрятного человека. Разброс значений типичен для прозвищной системы: одно и то же слово в разных местностях несло противоположную оценку.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шобины — это буквально «дети, родня Шобы». Такая модель образования характерна для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин так же часты, как на юге — на -ов. В переписных книгах XVII века фамилия встречается в Вятке и на Урале: например, в 1678 году в Хлыновском уезде записан крестьянин Федька Шобин. Вятские и пермские архивы вообще дают много примеров этой фамилии, что указывает на её севернорусское происхождение.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркскими языками, где «шоб» означает «пастух» или «подпасок». Однако для русского ономастикона такая версия выглядит натяжкой: фамилия плотно привязана к северным русским говорам, а не к южным степным регионам, где тюркские заимствования обычны. Скорее всего, Шоба — исконно русское прозвище, и фамилия Шобина — не редкая, но и не массовая, встречающаяся в основном в Кировской области, Пермском крае и Удмуртии.