Фамилия Шомротов — один из тех случаев, где корень заставляет задуматься. Если отбросить типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Шомрота), остаётся основа «Шомрот». Прямого славянского слова с таким звучанием в литературном языке нет, поэтому искать объяснение стоит либо в прозвище, либо в диалекте, либо в заимствовании из тюркских языков.

Самая вероятная версия выводит фамилию от тюркского имени или прозвища. В башкирском, татарском и казахском языках есть корень «шом» или «шомур», связанный с понятиями «тревога», «беспокойство», «смута». Соответственно, «Шомрот» могло означать человека беспокойного, суетливого, или, наоборот, того, кто сеет смуту. В тюркской ономастике нередки имена-обереги с отрицательным значением — чтобы отвести от ребёнка злые силы: назвали Беспокойным, а он вырастет спокойным. Суффикс -от в таком случае мог быть адаптирован под русское ухо.

Вторая гипотеза, менее распространённая, связывает фамилию с диалектным глаголом «шомроть» или «шомрать», который в некоторых говорах (например, на Русском Севере) означал «шарить», «рыться», «возиться». Шомротом тогда называли неугомонного, вечно копающегося человека, или того, кто «шомрает» по сусекам. Эта версия правдоподобна, если фамилия имеет чисто русские корни, но фиксация такого слова в словарях крайне скудна.

Фамилия редкая. Её география — преимущественно Оренбургская область, Башкортостан и Татарстан. Это косвенно подтверждает тюркскую версию происхождения: именно в этих краях активно смешивались русские и тюркские антропонимы. Шомротовы могли быть выходцами из крестьян или казаков, получившими фамилию по прозвищу отца, которое со временем утратило своё первоначальное значение.