Фамилия Шопугина — женская форма фамилии Шопугин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя, а сама фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ин, который указывал на принадлежность: «чей?» — «Шопугин», то есть сын или потомок Шопуги. Этот суффиск характерен для фамилий, образованных от основ на -а, -я, что и происходит в данном случае.

Корень фамилии — «шопуга». Слово это не встречается в современных словарях, но его можно попытаться реконструировать. Вероятнее всего, это диалектное прозвище, связанное с глаголом «шопотать» или «шептать». В говорах русского Севера и Сибири «шопот» означал шёпот, а «шопуном» или «шопотником» могли называть тихого, неразговорчивого человека либо, напротив, того, кто любит шептаться и сплетничать. Вторая версия, менее вероятная, связывает «шопугу» с тюркскими заимствованиями: в некоторых тюркских языках «шоп» означает «сор», «мусор», и прозвище могло относиться к неаккуратному человеку. Однако фонетически русские фамилии редко образуются от таких основ напрямую, поэтому версия с «шептуном» выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия Шопугин встречается редко. По данным открытых источников, основные очаги — Кировская область и Удмуртия, что косвенно подтверждает севернорусское или вятское происхождение. В этих краях диалектная лексика сохранялась дольше, и прозвища вроде «Шопуга» могли закрепиться за конкретным родом.

Социальный контекст фамилии типичен для крестьянской среды: прозвище давалось по внешнему признаку или поведению, а при переходе в фамилию теряло первоначальный смысл. Шопугины, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, не принадлежавшими к дворянству. В документах XIX века фамилия могла писаться с вариантами — Шопугин, Шапугин (под влиянием аканья), но форма с «о» считается исходной.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то «Шопотов» или «Шептунов» встречаются чаще, но «Шопугин» — более редкий вариант, где суффикс -уг- (как в «пичуга», «зверюга») придавал прозвищу эмоциональную или уменьшительную окраску. Таким образом, предок-носитель фамилии мог быть человеком с тихим голосом или, наоборот, любителем пошептаться — и это отличие закрепилось за его потомками.