Фамилия Шовтута представляет собой фонетический вариант фамилии Жовтута, которая ведет свое начало от прозвища Жовтий. Это прозвище восходит к прилагательному «желтый». Вполне вероятно, что данное именование указывало на особенности внешности предка: русые волосы, бледный цвет лица. По другой версии, фамилия Шовтута имеет литовские происхождение и образована от прозвища Шовт. Основой для него послужило литовское слово šovotas, то есть «дуплистый». Так могли назвать человека крупного телосложения. Кроме того, можно предположить, что Шовтом нарекали того, чей дом стоял рядом с деревом, имевшем большое дупло. Так и прозвище Жовтий закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шовтута. При образовании славянских фамилий использовались различные форманты: окончания принадлежности (-ов/-ев, -ин, -ский/-цкий), уменьшительные суффиксы (-онок/-енок, -енко, -ко, -ец, -ек, -ик, -чик, -еня, -ута), суффиксы отчества (-ович/-евич, -ич) и др. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Жовтий, со временем получил фамилию Шовтута.