Фамилия Шубяковский — редкий пример, когда прозвище, связанное с ремеслом, превратилось в «географическую» фамилию. В основе лежит слово «шуба» или профессия «шубник» (скорняк, выделывающий овчины и шьющий тулупы). Однако суффикс -овский указывает не на прямую принадлежность отцу (как -ов или -ин), а на происхождение из определённого места. Скорее всего, предок был не просто мастером, а жил в населённом пункте с названием вроде Шубяково, Шубовка или Шубники, либо владел землёй, которая называлась Шубяковским хутором.

В польской и западнорусской ономастике фамилии на -ский (-цкий) традиционно считались дворянскими или шляхетскими, но на практике они широко распространились и среди крестьян, особенно после отмены крепостного права, когда многие получили фамилии по названию деревни. Шубяковский — типичный пример такой «топонимической» фамилии: её носитель — «тот, кто из Шубяков». Если бы фамилия образовалась напрямую от ремесла, она звучала бы как Шубин, Шубников или Шубов.

Интересно, что в русских говорах слово «шуба» могло означать не только одежду, но и снежный покров, наст, а в некоторых регионах — даже вид рыбы. Однако для фамилии Шубяковский связь с меховым делом остаётся основной и наиболее логичной, тем более что профессия скорняка была распространена повсеместно. Встречаются варианты написания через «е» — Шебяковский, что может указывать на акающее произношение в южных говорах, но корень остаётся тем же.

Точных сведений о первых носителях этой фамилии в открытых источниках мало. Она не входит в число массовых, что говорит о её локальном бытовании — возможно, в пределах одного уезда или даже одной деревни. Поиск по географическим картам может дать результат: если найдётся урочище или бывший хутор Шубяковский на территории бывшей Речи Посполитой или центральной России, это будет прямым подтверждением версии о происхождении фамилии от места жительства.