Фамилия Шудыкина — женская форма фамилии Шудыкин, и её происхождение прямо связано с прозвищем или нецерковным именем Шудыка. В основе лежит диалектное слово «шуда» или «шудый». В разных говорах «шудой» могли называть человека тщедушного, худого, щуплого — то есть прозвище давалось по внешнему виду. Встречается и другая трактовка: в некоторых северных и сибирских говорах «шуда» означала «беда», «несчастье», и прозвище Шудыка мог получить ребенок, родившийся в трудное для семьи время, или человек, с которым постоянно случались неприятности.

Словообразовательная модель проста: к основе Шуд- добавляется суффикс -ык (уменьшительный или прозвищный), а затем фамильный суффикс -ин, характерный для русских фамилий, образованных от слов мужского рода на -а/-я. Типичная схема: Шудыка → сын Шудыки → Шудыкин. Такая модель широко распространена на Русском Севере и в центральных областях России, где прозвища на -ыка были особенно употребительны.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще указывали на отчество от полного имени, Шудыкин — фамилия от прозвища, а не от крестильного имени. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был известен в своей общине именно под этим прозвищем, и оно закрепилось за его потомками. В писцовых книгах XVI–XVII веков можно встретить схожие фамилии: Шудин, Шудов, Шуднев — все они восходят к тем же корням.

Географически фамилия Шудыкин (и Шудыкина) тяготеет к Вятке, Пермскому краю и Удмуртии. В этих регионах слово «шудый» в значении «худой, тощий» фиксируется диалектологами до сих пор. Встречается она и в Поволжье, но реже. Таким образом, носительница фамилии Шудыкина с высокой вероятностью имеет предков из северо-восточной части России, где прозвища по внешним признакам давали особенно охотно.