Фамилия Шугсенов звучит необычно для русского уха, и это первый ключ к разгадке. Скорее всего, мы имеем дело не с исконно русской, а с тюркской или кавказской фамилией, которая прошла русификацию через суффикс -ов. Этот суффикс в данном случае — типичный маркер адаптации нерусского прозвища или имени в официальную русскую фамилию, особенно в XIX—XX веках.

Основа «Шугсен» не имеет прямых аналогов в славянских языках. Наиболее вероятна её связь с тюркскими корнями. Можно предположить, что в основе лежит слово «шук» или «шуга» (в разных тюркских языках — «тихий», «спокойный», «смирный»), а аффикс «-сен» может быть притяжательным или образовывать имя. В таком случае Шугсен — это древнее личное имя или прозвище, означавшее «тихоня», «спокойный человек». Вторая версия, менее вероятная, но возможная для регионов Кавказа, — связь с аварским или кумыкским словом, обозначающим «радость» или «веселье» (ср. «шагь» — радость). Тогда Шугсен могло быть пожелательным именем: «будь радостным».

Поскольку фамилия редкая и не фиксируется в массовых списках дворянства или купечества, её носители, вероятно, происходили из крестьянских или казачьих слоёв, переселившихся в русскоязычную среду из тюркоязычных регионов (Поволжье, Кавказ, Средняя Азия). Фамилия могла закрепиться во время переписей, когда местному жителю с именем Шугсен добавили стандартное русское окончание. Географически фамилия может быть привязана к Астраханской области, Дагестану или Чечне, но без генеалогического исследования точнее сказать сложно.

Словообразовательная модель проста: тюркское личное имя Шугсен + русский патронимический суффикс -ов. Никаких дополнительных суффиксов, указывающих на сословие или профессию, здесь нет. Фамилия говорит о происхождении предка, а не о его ремесле.