Фамилия Шукакидзе — яркий пример грузинской модели образования родовых имен. Ее выдает характерный суффикс -дзе, который в переводе с грузинского означает «сын». В западной Грузии этот формант был основным способом указать на происхождение от отца или предка, в то время как в восточных регионах чаще использовали -швили («дитя»). Таким образом, Шукакидзе — это буквально «сын Шукаки».

Корень фамилии — личное имя или прозвище Шукака (Шукаки). В грузинской антропонимике это, скорее всего, уменьшительно-ласкательная форма от более полного имени. Наиболее вероятная версия возводит основу к имени Шукри, которое имеет арабские корни и означает «благодарность» или «благодарный». В таком случае Шукака — это домашнее, сокращенное обращение к человеку по имени Шукри. В пользу этой гипотезы говорит распространенность подобных сокращений в грузинском языке: например, от имени Георгий образуется Гия, от Давида — Дато.

Менее распространенное, но возможное объяснение связывает корень с тюркским словом «шука» — «шутка» или «насмешка». Если предок получил прозвище Шукака за веселый нрав или склонность к остротам, то фамилия могла закрепиться за его потомками. В этом случае она относится к группе «характерологических» фамилий, описывающих поведение человека.

Фамилия Шукакидзе довольно редкая за пределами Грузии. Ее ядро — историческая область Имеретия и прилегающие районы западной Грузии, где фамилии на -дзе встречаются особенно часто. Сословная принадлежность носителей, скорее всего, была разной: среди грузинских фамилий на -дзе встречаются как княжеские роды, так и крестьянские. Однозначно определить, к какому сословию относились первые Шукакидзе, без генеалогического исследования невозможно, но сама модель фамилии не указывает на аристократическое происхождение.

В русском языке фамилия не склоняется, если речь идет о женщине (Анна Шукакидзе), и склоняется как существительное мужского рода (к Ивану Шукакидзе, с Петром Шукакидзе).