Фамилия Шуксталь — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, это пример искусственной или «кабинетной» фамилии, характерной для духовного сословия в XVIII–XIX веках. Семинаристам нередко давали фамилии, образованные от латинских или греческих слов, а также переведённые на эти языки русские прозвища. В основе «Шуксталь» можно увидеть немецкое «Schuckstahl» или его вариант, что буквально означает «кусок стали» (Schuck — кусок, Stahl — сталь). В таком случае фамилия могла быть дана как калька с прозвища «Стальной», «Крепкий», «Твёрдый» — по аналогии с семинарскими фамилиями вроде Феррум (лат. «железо») или Сталь.

Другая версия отталкивается от белорусского или польского корня. В этих языках существует слово «шукста» — так называли шалуна, проказника или суетливого человека. Если добавить к нему суффикс -ль (как в фамилиях Коваль, Швец), то «Шуксталь» могло означать «тот, кто шумит, баламутит». Но эта гипотеза слабее: суффикс -ль в чистом виде редко встречается в восточнославянских фамилиях без дополнительных окончаний.

География фамилии узкая. Шукстали встречаются в основном в западных регионах бывшей Российской империи — на территории современной Беларуси и Литвы, а также среди потомков переселенцев в Сибири. Это подтверждает версию либо о немецком влиянии (через лютеранские общины), либо о польско-белорусском происхождении. В любом случае, носитель фамилии Шуксталь почти наверняка имеет предка, получившего её не по наследству от отца, а в результате «фамильной реформы» — при поступлении в семинарию или при переходе в другое сословие.

Разобрать фамилию по классической схеме (корень-суффикс-окончание) сложно: окончание -ль нехарактерно для русских фамилий, а основа «шукст» не даёт однозначной этимологии в славянских языках. Поэтому наиболее правдоподобным остаётся вариант с искусственным образованием от немецкого «Schuckstahl» — звучная, «учёная» фамилия, которую давали с намёком на характер или внешность её первого носителя.