Фамилия Шульгеня — редкий случай, когда ареал бытования почти наверняка указывает на происхождение раньше, чем разбор корня. Основная масса носителей сосредоточена в западных областях Беларуси и на востоке Польши, в регионе, который исторически был Подляшьем и Гродненщиной. Это сразу отсекает версию о русском или украинском происхождении: перед нами типично белорусская фамилия, образованная по польско-белорусской словообразовательной модели.

Центральный элемент — корень «шульг-». В польском и белорусском диалектах «szulga» или «шульга» означало «левша». В переносном смысле так могли назвать неловкого, неуклюжего человека или того, кто всё делает «не так, как люди». Основа та же, что в польской фамилии Szulga и в русской Шульгин, но суффикс кардинально меняет историю.

Суффикс «-еня» (белор. «-эня») — уменьшительно-ласкательный или патронимический, характерный именно для белорусской антропонимии. Он аналогичен русскому «-енька» или польскому «-enia». В фамилиях он часто фиксировал прозвище сына по отцу: Шульгеня — буквально «маленький Шульга» или «сын Шульги». Таким образом, первый носитель фамилии был сыном человека, которого окрестили Левшой.

Встречается также вариант написания Szulgenia (с «Sz»), что подтверждает польское влияние на орфографию. В документах XIX века фамилия могла записываться как Шульгеня, Шульгеня, а в церковных книгах — через «е» после «г». Никакой связи с тюркским «шульген» (потоп, наводнение) или немецким «Schulze» (староста) здесь нет — это ложные созвучия, которые возникают при попытке вывести фамилию за пределы её реального бытования.

Социальный контекст прост: фамилия принадлежала крестьянскому или мещанскому сословию. В шляхетской среде Подляшья такие прозвищные фамилии на «-еня» тоже встречались, но реже. Дворянские гербовники её не фиксируют. Таким образом, Шульгеня — это белорусская фамилия-прозвище, которая говорит о леворукости или нестандартности предка, закреплённая в форме «сын Левши».