Фамилия Шулгины образована от личного прозвища Шулга. В древнерусском языке «шулга» означало «левша», то есть человек, который лучше владеет левой рукой, чем правой. Прозвище было распространённым, ведь в крестьянской и ремесленной среде леворукость часто замечали и закрепляли в имени. Отсюда же пошли однокоренные фамилии Шулепов, Шулепин, Шульгин, но у Шулгиных своя особенность.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шулгины — это «дети Шулги». Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге. В отличие от фамилии Шульгин, где основа «шульга» с мягким знаком, вариант «шулга» без смягчения — более архаичный. Он мог закрепиться в говорах, где твёрдый звук сохранялся дольше, или в результате случайного упрощения на письме.

Среди носителей этой фамилии преобладали крестьяне и посадские люди. В документах XVII–XVIII веков Шулгины встречаются в переписных книгах Вологодского, Архангельского и Костромского уездов. Например, в 1678 году в деревне Шулгино (название тоже от прозвища) записан крестьянин Фёдор Шулга. Позже фамилия закрепилась за целыми семьями, и к XIX веку Шулгины стали распространённой фамилией в северных губерниях, особенно в Вятской и Пермской.

Есть и другая версия происхождения: от слова «шулга» в значении «левый берег реки» или «излучина». В этом случае прозвище мог получить человек, живший на левом берегу или у поворота реки. Но лингвисты считают это менее вероятным: в источниках слово в таком значении почти не зафиксировано, а вот прозвище Левша — одно из самых типичных для русских фамилий. Так что Шулгины — потомки человека, который отличался от других тем, что делал всё левой рукой.