Фамилия Шуптыров — редкий случай, когда её форма почти полностью совпадает с исходным прозвищем. В ней нет привычного суффикса принадлежности -ов, который присоединяют к основе на твёрдый согласный (Петров, Иванов). Здесь суффикс -ов стоит после конечного -р, но сама основа — «Шуптыр» — выглядит как готовая фамилия в именительном падеже. Это говорит о том, что прозвище Шуптыр было настолько устойчивым, что при оформлении фамилии его почти не переделали, просто добавили патронимический суффикс.

Корень «шупт-» в русских говорах имеет два основных значения. Первое — диалектное «шуптырь» или «шуптура»: так в северных и сибирских областях называли мешок, котомку, узел с вещами. Человек, который всегда носил с собой котомку, мог получить прозвище Шуптырь, а его потомки — Шуптыровы. Второе значение — звукоподражательное: «шуптыркать» означало шептать, бормотать, говорить невнятно, а «шуптырь» — ворчун или неразборчиво говорящий человек. Оба варианта возможны, но прозвище от «мешка» кажется более вероятным: такие бытовые прозвища по предмету одежды или поклаже встречаются у русских фамилий часто (Котомкин, Мешков).

Суффикса -ов в фамилии Шуптыров — стандартный, он указывает на принадлежность: «сын Шуптыра». Такая модель была самой распространённой в центральной и северной России, где фамилии формировались в XV–XVII веках. Географически фамилия тяготеет к Пермскому краю, Кировской области и Удмуртии — регионам, где диалектное слово «шуптырь» действительно фиксировалось этнографами.

Спорных версий у Шуптырова немного. Иногда её связывают с тюркским корнем «шуп» (мусор, отбросы), но это натяжка: для тюркского заимствования в фамилии нехарактерен суффикс -ыр, и ареал фамилии чисто русский. Гораздо правдоподобнее, что предок носителя фамилии был либо странником с котомкой, либо неразговорчивым человеком — и это прозвище закрепилось за его родом.

В отличие от фамилий с прозрачной географической привязкой (Вологжанинов, Казанцев), Шуптыров — чисто прозвищная фамилия, где социальный статус предка не зашифрован: им мог быть и крестьянин, и ремесленник. Единственное, что можно сказать уверенно: фамилия исконно русская, сформировалась в среде, где диалектная лексика была повседневной, и сохранила редкую основу, которая сегодня почти вышла из употребления.