Фамилия Шушке — редкий случай, когда славянская основа «причёсана» под немецкую или польскую орфографию. На слух это звучит как «Шушке» или «Шушкэ», а на письме выдаёт нехарактерное для русского языка окончание -е. В большинстве случаев это не исконно русская фамилия, а результат адаптации польской, белорусской или украинской фамилии Шушко, Шушка или Шушкевич. Конечное -е — типичный признак польского именительного падежа (например, Коваль → Ковале, но в русском восприятии застыло как фамилия в форме «на кого?»). Второй вариант — немецкое или еврейское происхождение, где фамилия образована от диалектного Schuschke (уменьшительное от имени Шуша или от слова «шушукаться» в значении «шептаться»). Но для носителей из Восточной Европы первая версия правдоподобнее.

Основа фамилии — прозвище Шуша. В славянских говорах «шуша» означала человека невысокого роста, суетливого или того, кто говорит тихо, «шушукает». В украинском и белорусском языках «шуша» — ещё и мелкая сошка, незначительный человек. Суффикс -к- в исходной форме (Шушка, Шушко) уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный, как в фамилиях Козка, Рыбка. Фамилии на -ко (Шушко) типичны для Украины, а на -ка (Шушка) — для Беларуси. Форма Шушке, скорее всего, закрепилась при переселении носителя в регионы с польским или немецким влиянием — например, в Западную Беларусь, Литву или даже в Прибалтику, где фамилии не склоняли и записывали в исходном падеже.

В польских метриках встречается фамилия Szuszke — вариант с шипящим «ш» и тем же окончанием. Это указывает на то, что предок мог быть поляком или белорусом-католиком. Если же фамилия записана через «и» (Шушке), а не через «е» (Szuszke), это иногда говорит о литовском влиянии: в литовском языке фамилии часто оканчиваются на -е и не склоняются по падежам.

Сословно фамилия неэлитарная: в основном её носили крестьяне и мещане. В дворянских гербовниках Шушке не зафиксированы. Географически фамилия редкая, но встречается в Беларуси (особенно Гродненская и Минская области), на востоке Польши и среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В России XIX века носителей Шушке почти нет — это маркер западного происхождения.

Если вы носитель этой фамилии и живёте в России, скорее всего, ваши предки переехали с запада в ходе переселенческих волн конца XIX — начала XX века или во время Первой мировой войны. Ударение, судя по аналогиям, падает на первый слог: Шу́шке.