Фамилия Шушкин образована от прозвища Шушка. По одной из версий, оно ведет свое начало от украинского глагола «шушкати» - «шептать». Вероятно, Шушкой прозвали либо обладателя тихого голоса, либо же скрытного, подозрительного человека. Возможно также, что прозвище Шушка восходит к распространенному в пермских говорах глаголу «шушкать» - «пить». Исходя из этого, можно предположить, что Шушкой прозвали любителя хмельных напитков. Так и прозвище Шушка закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шушкин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шушка, со временем получил фамилию Шушкин.