Фамилия Шушмаркин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с профессией или внешностью, а с конкретным, немного насмешливым действием. Основа «шушмаркать» в русских говорах означала «шуршать, шептаться, говорить тихо и невнятно». Человек, которого прозвали Шушмарка, — это тот, кто говорил себе под нос, бормотал или, возможно, тайком перешёптывался. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Шушмаркин, то есть сын или потомок Шушмарки.

В отличие от более распространённых фамилий на -ов, -ин здесь не от имени, а от прозвища с яркой звукоподражательной окраской. Слово «шушмаркать» родственно диалектному «шу-шу» — подражанию шёпоту. Интересно, что в некоторых говорах «шушмаркой» могли назвать и неопрятного, взлохмаченного человека — по ассоциации с шуршанием старой одежды. Но основная версия, более убедительная по словообразованию, — это прозвище по манере речи.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается она в Вологодской, Кировской и Пермской губерниях — там, где диалектное слово «шушмаркать» было в ходу. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с таким прозвищем, но ни одного дворянского рода Шушмаркиных не зафиксировано. Фамилия осталась в крестьянской и мещанской среде, без перехода в высшие сословия.

Сравните с однокоренными Шушманов, Шушунов — все они образованы от тех же звукоподражательных основ, но Шушмаркин выделяется более сложной суффиксальной цепочкой: корень «шуш-», суффикс «-марк-» (как в «шептун»), и только потом фамильный «-ин». Это редкая модель, что делает фамилию ценной для ономастики как пример народного словотворчества.