Фамилия Шушуканова — женская форма фамилии Шушуканов, и её разговорный, почти звукоподражательный корень сразу выделяет носителя среди множества «стандартных» фамилий на -ов/-ев. В основе лежит глагол «шушукать» — говорить шёпотом, тайком, перешёптываться. Прозвище Шушука, Шушукан или Шушукало давали в старину человеку, который привык говорить тихо, секретничать или, наоборот, постоянно нашёптывал что-то на ухо. В русских говорах слово «шушука» могло означать не только шептуна, но и сплетника, переносчика слухов — того, кто «шушукается» по углам.

Модель образования проста: от прозвища Шушукан с помощью патронимического суффикса -ов возникла фамилия Шушуканов. Суффикс -ан в прозвище указывает на лицо, склонное к действию (ср. «крикун», «молчун»), то есть Шушукан — «тот, кто постоянно шушукает». Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, поскольку образована от бытового, нецерковного прозвища. Встречается она преимущественно в центральных и южных регионах России, где сохранилась диалектная лексика.

Интересно, что однокоренные фамилии — Шушунов, Шушурин, Шушканов — могут иметь ту же основу, но с разными суффиксами. Шушуканов же выделяется именно глагольным оттенком: это не просто «шептун», а человек, чья манера речи стала его постоянной характеристикой. В дореволюционных переписях такие фамилии фиксировали редко, поэтому точных данных о географическом распространении Шушукановых немного, но ясно, что фамилия не искусственная и не книжная — она родилась в живой речи.