В основе фамилии Шуйский лежит аналогичное прозвище, которое восходит к названию города Шуя, расположенного в Ивановской области. Соответственно, прозвище Шуйский получил уроженец этого города. Существует несколько версий объяснения топонима Шуя: от русского слова «ошуйя» - «левый», а также от финского suja - «талый», «половодье». Не исключено, что именование Шуйский получил выходец из одного из сел с названием Шуйское, расположенный в Вологодской и Смоленской областях. Известен дворянский род Шуйских, восходящий к XVII веку и записанный в VI часть родословной книги Гродненской губернии.