Фамилия Шварыгин образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который присоединялся к основам на -а/-я. Это значит, что в основе лежит прозвище или имя Шварыга. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Шварыги» или «человек из рода Шварыги».

Корень слова — швар- — звучит нехарактерно для исконно славянской лексики. Самая вероятная версия связывает его с диалектным глаголом «шварыгать» — греметь, стучать, бросать с шумом, а также работать кое-как, делать что-то небрежно. В псковских и тверских говорах «шварыгать» означало «шарить», «рыться». В таком случае Шварыга — прозвище человека шумного, суетливого или неаккуратного в работе. Менее распространённое значение — «шварыга» как вид плети или кнута, что могло указывать на человека резкого, вспыльчивого.

Встречается и альтернативная версия — от немецкого Schwär(e) — «нарыв», «опухоль», но она маловероятна для русской фамилии: прозвища по болезням обычно давали напрямую (Гной, Чирей), а не через иноязычное слово. Скорее всего, корень диалектный, местный.

Фамилия редкая, географически привязана к центральным и северо-западным областям России. Встречается в старых переписях Вятской и Костромской губерний, где «шварыгать» было в ходу. Интересно, что фамилия не получила дворянского распространения — её носители в основном крестьяне и мещане, что подтверждает бытовое, прозвищное происхождение. В современной России Шварыгины живут небольшими группами, преимущественно в Кировской и Нижегородской областях.