Фамилия Шынтаков — редкая и неочевидная для русского уха. На первый взгляд она напоминает множество фамилий на -ов, образованных от тюркских основ, но в данном случае корень не лежит на поверхности. Анализ начинается с суффикса: -ов указывает на русскую модель патронимии (буквально «чей?» — сын Шынтака). Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Шынтак.

Самая вероятная версия связывает Шынтак с тюркским словом «шын» (истина, правда, верность) в сочетании с аффиксом -так, который мог означать обладателя качества. То есть Шынтак — «правдивый», «верный», «искренний». В казахском и башкирском языках слово «шын» сохраняет это значение, а фамилии с таким корнем встречаются в южноуральском регионе и Западной Сибири, где исторически жили тюркские народы. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия не фиксируется в старых русских боярских или крестьянских списках — она явно позднего, «инородческого» происхождения, возникшая после крещения или приписки к русскому сословию.

Менее вероятен, но возможен вариант, что Шынтак — это искажённое звучание арабского имени Шинтак (от «шин» — достоинство), но в тюркской среде оно не было распространено. Также стоит отбросить гипотезу о связи с русским «шинь» или «шина» — фонетически нестыковка.

Географически носители фамилии Шынтаков сегодня встречаются в основном в Казахстане и приграничных областях России (Оренбургская, Челябинская), что подтверждает тюркскую основу. Если предки носили это имя, они, скорее всего, были скотоводами или воинами, для которых «правдивость» — ценимое качество, а не ремесленная характеристика. Фамилия не получила широкого распространения, поэтому каждый её носитель — носитель редкого антропонима, сохранившегося в узком роду.