Фамилия Шюпликов — редкий случай, когда необычное звучание не обманывает: её корни действительно нерусские, но фамилия при этом давно и прочно обрусела. В основе лежит немецкое слово Schüppel (читается как «шюппель») — так в некоторых диалектах называли связку, пучок или копну сена. Прозвище Шюппель мог получить либо крестьянин, занятый заготовкой сена, либо человек со светлыми, «пушистыми» волосами, напоминающими копну. В России немецкие переселенцы, особенно из Поволжья, нередко получали фамилии от своих диалектных прозвищ.

Фамилию строили по типичной русской модели: к основе Шюппель- добавили суффикс -ик (уменьшительная или именная форма, как в фамилиях Кузнецов/Кузнечиков), а затем — патронимический суффикс -ов. Получается цепочка: прозвище Шюппель → Шюплик (сын или потомок Шюппеля) → Шюпликов. Вариант с суффиксом -ик мог возникнуть уже на русской почве, когда носителя немецкого прозвища в быту стали звать Шюпликом, а его детей — Шюпликовыми.

Географически фамилия тяготеет к регионам массового расселения немецких колонистов: Саратовская, Самарская, Волгоградская области, а также юг Украины. Встречается она крайне редко — по открытым данным, в современной России насчитывается не более нескольких десятков её носителей. Из-за редкости фамилия почти не попала в классические ономастические словари, что делает её особенно интересной для семейного историка.

Единственная альтернативная версия — связь с диалектным русским словом «шюплить» (говорить невнятно, шепелявить), но она слаба: такого глагола нет в литературном языке, а в говорах он не зафиксирован в качестве основы для фамилий. Немецкое происхождение объясняет и необычное сочетание «шю», и сам корень, и исторический контекст миграций XVIII—XIX веков.