Фамилия Сиксяева — редкий пример, где прозрачная основа скрывает неочевидное происхождение. На первый взгляд корень «сикс-» наводит на мысль о заимствовании из английского six (шесть), но это ложный след: фамилия исконно русская, и её истоки лежат в диалектной лексике северных и уральских говоров.

В русских говорах слово «сикся» (или «сикса») имело несколько значений. В архангельских и вологодских диалектах так называли синицу, а в пермских — мелкую, юркую рыбу, чаще всего снетка или ряпушку. Прозвище Сикся могли дать либо маленькому и подвижному человеку (по аналогии с птицей), либо рыбаку, промышлявшему мелкой рыбой. Ещё одна версия связывает «сиксю» с глаголом «сикать» — в некоторых говорах это означало «мочиться», что могло стать бытовым, не всегда лестным прозвищем, но для фамилий XVIII–XIX веков такие основы не редкость.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Сиксяев — буквально «сын Сикси» или «человек из семьи Сикси». Форма с окончанием -ая (Сиксяева) — типичная для женского варианта фамилии, но в русской традиции она закрепилась и как неизменяемая фамилия для женщин, и как исходная форма, от которой образован мужской вариант Сиксяев. Такая словообразовательная модель характерна для фамилий, возникших в среде крестьян и мещан северных губерний России.

Географически фамилия тяготеет к Пермскому краю и Кировской области. В этих регионах встречаются её варианты — Сиксов, Сиксин, Сиксяков, что подтверждает локальность корня. В центральных областях России фамилия практически не фиксируется, что говорит о её узкорегиональном происхождении.

О дворянском или знатном происхождении Сиксяевых данных нет. Скорее всего, предки носителей фамилии были крестьянами или мелкими торговцами рыбой на Урале. Поскольку фамилия редкая, её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких соседних селений, где прозвище Сикся было распространено.

В современных телефонных справочниках и базах данных фамилия Сиксяева встречается единично, в основном в Перми и Екатеринбурге. Это делает её ценным маркером для генеалогического поиска: если вы носите эту фамилию, ваши корни почти наверняка ведут в северное Прикамье или Вятку, а среди предков были люди, промышлявшие рыбой или жившие на лесных реках.