Фамилия Синипутова — яркий пример того, как в русской фамилии сплелись цвет, характер и бытовая наблюдательность. В её основе лежит прозвище Синий Пут или Синипут. Первая часть, «синий», в древнерусском языке означала не только цвет, но и тёмный, смуглый, а иногда — печальный или странный. Вторая часть, «пут», — слово многозначное: это и дорога, и верёвка, и путы (оковы). Скорее всего, прозвище дали человеку, который либо ходил по «синим» (дальним, глухим) путям, либо носил одежду из синей крашенины, либо был чем-то «привязан» к синему цвету — например, имел синеватый оттенок кожи от болезни или постоянной работы с красителями.

Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Синипутов — сын или потомок Синипута. Женская форма Синипутова образована по стандартной модели. Фамилия редкая и, скорее всего, севернорусская или сибирская по происхождению. В центральных областях её почти не фиксируют, зато в архангельских и вологодских переписях XVII–XVIII веков встречаются прозвища, построенные по той же схеме: «Синебрюхов», «Синегубов». Там, где ремёсла были связаны с окраской тканей (например, в слободах красильщиков), такие прозвища давали без злого умысла — просто по внешнему признаку или занятию.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и как прозвище бродяги или странника: «синий путь» — это путь, уходящий вдаль, в неизвестность. В говорах «синь-порох» означало даль, а «синепутьем» называли глухую дорогу. Таким образом, предок Синипутовых мог быть человеком, который много ходил, торговал или водил обозы по глухим трактам. Других версий, например, связи с тюркскими корнями или с христианскими именами, у этой фамилии нет — она чисто русская, разговорная, бытовая.

Сегодня носительницы фамилии Синипутова живут в основном на Урале и в Поволжье. Встречается она редко, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем легче восстановить историю конкретного рода.