Фамилия Синофеева — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней сразу бросается в глаза суффикс -еев, который в русских фамилиях встречается реже, чем привычный -ов или -ин. Этот суффикс — фонетический вариант -ев, который присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на «й». Но в случае с Синофеевым мы видим основу на твёрдый «ф» — значит, перед нами не стандартная модель, а скорее след адаптации нерусского имени или прозвища.

Самая вероятная версия связывает фамилию с греческим именем Синоф (Σινώφ) или его производными. В греческой ономастике имя Синоф встречается как каноническое, хоть и нечастотное. В русской традиции такие имена могли попадать через святцы или через контакты с греческим духовенством. Тогда фамилия Синофеев строится по простой схеме: имя Синоф → притяжательное прилагательное «Синофеев» (чей? — Синофеев сын). Суффикс -еев здесь возник потому, что в исходном имени конечный согласный «ф» в косвенных падежах смягчался (Синофя, Синофю), и форма «Синофеев» закрепилась по аналогии с фамилиями на -еев от имён на -ий (как Андреев).

Вторая гипотеза, менее правдоподобная, но имеющая право на существование, — связь с тюркским корнем. В татарском и башкирском языках есть слово «сын» (статуя, идол, а иногда и «образ») и «уф» (звукоподражательное или усечённое). Однако убедительных параллелей, которые дали бы фамилию Синофеев, в тюркских фамилиях не обнаружено. Скорее всего, это народная этимология.

Географически фамилия Синофеева привязана к центральным и южным регионам России, с небольшим числом носителей в Ростовской области и Ставрополье. В дореволюционных метрических книгах она встречается в среде крестьян и мещан, что говорит о её демократическом происхождении: никакого дворянского корня, только имя, данное при крещении, и отчество, превратившееся в фамилию.

Таким образом, предки современных Синофеевых — скорее всего, люди, носившие редкое греческое имя Синоф, которое в быту превратилось в прозвище, а затем — в фамилию. Это не ремесленная и не топонимическая фамилия, а чисто патронимическая, образованная от личного имени, которое со временем почти исчезло из обихода.