Фамилия Сисенкова — женская форма от Сисенков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев типична для русских фамилий, образованных от прозвища или имени отца. В основе лежит мужское личное имя или прозвище Сисенок. Это уменьшительная форма с суффиксом -енок, который в древнерусском языке указывал на молодое существо или детёныша (сравните: телёнок, волчонок). Следовательно, Сисенок — это «маленький Сиса» или «сын Сисы».

Корень Сис- здесь самый интересный и спорный. В русской ономастике есть несколько версий его происхождения. Первая и наиболее вероятная — от канонического имени Сисий (греческого происхождения, от «сис» — «червивый» или из египетского имени). В просторечии имя Сисий могло сокращаться до Сиса, а от него уже образовывались прозвища Сисенок, Сисенков. Вторая версия — от прозвища, связанного с диалектным словом «сисый» (седой, белесый, иногда с оттенком «плешивый»). В этом случае Сисенок — «сын седого или плешивого человека». Третья, более редкая, отсылает к тюркским корням, где «сис» могло означать «нарыв» или «шишка», но для центральной России это маловероятно.

Географически фамилия Сисенков (и Сисенкова) встречается не повсеместно, а тяготеет к южнорусским и центральным областям, особенно к Тульской, Рязанской, Липецкой и Воронежской губерниям. Это подтверждает связь с диалектной лексикой и народными формами имён, характерными для этих регионов. Встречаются и другие однокоренные фамилии: Сисёв, Сисин, Сисяев — все они восходят к одному корню, но с разными суффиксами.

Таким образом, предок носительницы фамилии Сисенкова, скорее всего, был сыном человека по прозвищу Сисенок, а тот, в свою очередь, — сыном Сисы. Сиса мог быть либо крещёным с именем Сисий, либо человеком с заметной внешностью — седым или плешивым. Фамилия недворянская, а крестьянская или мещанская, что типично для модели на -ов/-ев.