Фамилия Сисютин ведет начало от крестильного имени Сисой, которое пришло на Русь вместе с христианством. Имя это древнееврейского происхождения, и его толкуют двояко: как «шестой» и как «беломраморный». Второе значение связано с тем, что в Священном Писании так именовали один из драгоценных камней, украшавших наперсник первосвященника.

В повседневном общении полное церковное имя звучало слишком торжественно, поэтому в ходу были его уменьшительно-ласкательные формы. От одной из них — Сисюта — и образовалась фамилия. Смысл такого прозвания прост: так могли звать младшего сына, если он был шестым ребенком в семье, либо просто ласково называть ребенка, носившего имя Сисой.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: к основе Сисют- добавили патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Первоначально Сисютин означал «сын Сисюты», то есть потомок человека, носившего это уменьшительное имя. Со временем притяжательное прилагательное закрепилось как родовое прозвание и передавалось уже по наследству, не меняясь.

Интересно, что у имени Сисой есть и другие производные формы, от которых пошли родственные фамилии — Сисоев, Сисейкин, Сисюкин. Все они восходят к одному источнику, но разошлись по разным ветвям рода. Это показывает, как живая народная речь дробила одно имя на множество вариантов, каждый из которых мог стать основой отдельной фамилии.

Точное место и время возникновения фамилии Сисютин назвать трудно. Процесс становления русских фамилий растянулся на несколько столетий, и в разных регионах он шел с разной скоростью. Крестьянские фамилии, как правило, окончательно закрепились лишь к XIX веку, тогда как у дворянства они появились значительно раньше. Вероятнее всего, Сисютины происходят из среды крестьян или посадских людей, где отчества в форме притяжательных прилагательных были особенно распространены.

В документах фамилия встречается в написании с буквой «ю» в корне, что отражает произношение уменьшительной формы. Подобное написание не редкость для фамилий, образованных от народных вариантов канонических имен: так же, например, появились Сюткины от Сюта (уменьшительное от Сисой или Созонт).

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия Сисютин — живой свидетель того, как церковное имя, пройдя через горнило народного языка, превратилось в устойчивый родовой знак, который и сегодня несет память о далеком предке, носившем имя Сисой.