Фамилия Ситмуханов — яркий пример антропонимики, возникшей на стыке тюркских языков и исламской традиции. Её основа — сложное имя Ситмухан, которое образовано сращением двух компонентов. Первая часть, «сит», восходит к арабскому слову «ситт» — «госпожа», «почтенная женщина». Вторая часть — «мухан» — это казахская или башкирская фонетическая форма имени Мухаммад (в диалектах звук «х» мог заменять «м» или «х» в начале, но здесь скорее всего «Мухан» — вариант от «Мухаммед»). Таким образом, имя Ситмухан буквально означает «госпожа Мухаммад» или «почтенная, как Мухаммад». Вероятно, так назвали мальчика в честь матери или бабушки, пользовавшейся большим уважением, либо это имя-оберег, подчёркивающее святость.

Суффикс «-ов» в фамилии — классический русский патронимический показатель, который в XIX–XX веках массово добавляли к тюркским фамилиям при русификации документов. Без суффикса фамилия звучала бы как Ситмухан, но в русском делопроизводстве её «обрусели» по модели «отчество + -ов». Встречается также вариант Ситмуханов, где ударение падает на последний слог, что типично для южноуральских и казахстанских говоров.

Географически фамилия редкая, её очаг — западный Казахстан (особенно Актюбинская область) и прилегающие регионы России: Оренбуржье, Башкортостан, Татарстан. В этих местах имя Ситмухан фиксируется в метрических книгах конца XIX века у казахов и башкир. Носители фамилии, скорее всего, происходят из среды кочевых или полуоседлых скотоводов, которые при переходе к оседлости получили фамилию по имени деда или отца.

Известных широкой публике носителей фамилии нет — это не фамилия аристократии или знати, а типичная «народная» фамилия, возникшая в крестьянской или рабочей среде. Встречаемость её крайне низкая: по открытым данным, в России и Казахстане живёт не более нескольких сотен человек с фамилией Ситмуханов. Для этимолога она интересна тем, что хорошо сохранила древнюю тюркскую модель двусоставного имени с арабским заимствованием, где женский компонент стал частью мужского имени — редкий случай в ономастике.